Центр сравнительной истории и теории цивилизаций разрабатывает следующие исследовательские направления: Современные подходы к изучению динамики всемирно-исторического процесса, возможности эволюционизма с учётом значительной роли неэволюционных изменений в историческом процессе, изучение различных моделей соотношения эволюционных и неэволюционных форм исторической изменчивости в переходные и кризисные эпохи, а также роли архаизующих тенденций в цивилизационном процессе, исследование миграций в эпоху Великого переселения народов и в ХХ – начале ХХI веках на основе цивилизационного подхода, изучение роли современных миграций как неотъемлемого компонента глобализации, сопровождающихся переструктуризацией мирового геополитического, геоэкономического и цивилизационного пространства. Центр выпускает периодический сборник «Цивилизации».